Techniker/in – 10x Genomics / Single-Cell Sequencing

Arbeitgeber: Biomarker Technologies (BMK) GmbH

Key Responsibilities



- Perform end-to-end single-cell sequencing workflows, including sample processing, single-cell dissociation, single-nucleus preparation, cell sorting, quality assessment, and library preparation.

- Execute and optimize single-cell experiments using platforms such as 10x Genomics, PARSE, or other single-cell technologies.

- Conduct molecular biology experiments including PCR, qPCR, nucleic acid extraction/purification, and NGS-related workflows.

- Handle human and mouse tissue samples and optimize protocols for challenging samples to improve experimental performance and data quality.

- Operate laboratory instruments including flow cytometers (FACS), cell counters, PCR/qPCR systems, and other molecular biology equipment.

- Analyze experimental results, maintain accurate laboratory records, prepare reports, and communicate findings with internal teams and customers when required.

- Troubleshoot experimental issues, improve laboratory workflows, and contribute to the development and validation of single-cell methodologies.

- Collaborate with research teams and support the training or supervision of junior team members when needed.



Requirements



- PhD degree in Cell Biology, Molecular Biology, Biotechnology, or related fields,

- or a Master’s degree with 1–3 years of relevant hands-on laboratory experience.

- Hands-on experience with single-cell sequencing platforms (10x Genomics or equivalent) and related experimental workflows.



Experience in:



- Single-cell suspension preparation and tissue dissociation (human/mouse tissues)

- Single-nucleus extraction/preparation

- Flow cytometry/FACS operation

- Molecular biology techniques including PCR, qPCR, purification, and NGS workflows

- Experience with protocol optimization, troubleshooting, and laboratory SOPs.

- Familiarity with organoids, recombinant AAV, screening, or low-input molecular assays is a plus.

- Basic experience with data analysis tools (e.g., Prism, Spotfire, or equivalent) and interest in bioinformatics is preferred.

- Good communication skills and ability to work collaboratively in a research environment.

- Willingness to travel when required.

- Proficiency in English (written and spoken).



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**Ihre Aufgaben**



- Durchführung von **Single-Cell-Sequencing-Workflows von A bis Z**, einschließlich Probenverarbeitung, Einzelzell-Dissoziation, Einzelkernpräparation, Zellsortierung, Qualitätskontrolle und Library Preparation. 

- Durchführung und Optimierung von **Single-Cell-Experimenten** mit Plattformen wie **10x Genomics, PARSE** oder vergleichbaren Single-Cell-Technologien. 

- Durchführung molekularbiologischer Arbeiten, einschließlich **PCR, qPCR, Nukleinsäureextraktion und -aufreinigung** sowie weiterer NGS-bezogener Workflows. 

- Arbeiten mit **humanen und murinen Gewebeproben** sowie Optimierung von Protokollen für anspruchsvolle Proben, um die experimentelle Leistung und Datenqualität zu verbessern. 

- Bedienung und Wartung von Laborgeräten, insbesondere **Durchflusszytometern (FACS), Zellzählern, PCR-/qPCR-Systemen** und weiteren Geräten der Molekularbiologie. 

- Analyse und Dokumentation experimenteller Ergebnisse, Führung präziser Laboraufzeichnungen, Erstellung von Berichten sowie Kommunikation der Ergebnisse mit internen Teams und bei Bedarf mit Kunden. 

- **Fehleranalyse und Troubleshooting** bei experimentellen Problemen sowie kontinuierliche Optimierung von Laborabläufen und Mitwirkung bei der Entwicklung und Validierung von Single-Cell-Methoden. 

- Zusammenarbeit mit Forschungs- und Projektteams sowie bei Bedarf **Unterstützung bei der Einarbeitung und Betreuung von Junior-Teammitgliedern**. 

- Bereitschaft zu **gelegentlichen Dienstreisen**. 



**Ihr Profil**



- **Promotion (PhD)** in Zellbiologie, Molekularbiologie, Biotechnologie oder einem verwandten Fachgebiet **oder** ein Masterabschluss mit **1–3 Jahren einschlägiger praktischer Laborerfahrung**.  

- Praktische Erfahrung mit **Single-Cell-Sequencing-Plattformen**, idealerweise **10x Genomics**, sowie mit den entsprechenden experimentellen Workflows. 

- Praktische Erfahrung in folgenden Bereichen: 

- Herstellung von **Einzelzellsuspensionen und Gewebedissoziation** aus humanen und murinen Geweben 

- \*\*Extraktion und Präparation von Einzelkernen (Single Nuclei)\*\* 

- Bedienung von **Durchflusszytometern / FACS** 

- Molekularbiologische Methoden, einschließlich **PCR, qPCR, Nukleinsäureaufreinigung und NGS-Workflows**

- **Protokolloptimierung, Troubleshooting und Erstellung bzw. Anwendung von Labor-SOPs** 

- Erfahrung mit **Organoiden, rekombinantem AAV, Screening-Verfahren oder Low-Input-Molekularassays** ist von Vorteil. 

- Grundkenntnisse in **Datenanalyse-Tools** wie Prism, Spotfire oder vergleichbaren Programmen sowie Interesse an **Bioinformatik** sind wünschenswert. 

- Gute **Kommunikations- und Teamfähigkeit** sowie Freude an der Zusammenarbeit in einem wissenschaftlichen Forschungsumfeld. 

- Sehr gute **Englischkenntnisse in Wort und Schrift**.