Arbeiten an der Charité
Die Arbeitsgruppe von Herrn Prof. Dr. med. Ulrich Keller sucht eine hochqualifizierte und motivierte Wissenschaftlerin bzw. einen hochqualifizierten und motivierten Wissenschaftler zur Durchführung einer Promotion (Ph.D.) im Bereich der translationalen Myelomforschung/Data Science.
Unsere Forschungsgruppe ist ein interdisziplinäres und innovatives Team aus Ärztinnen und Ärzten sowie Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern aus den Bereichen Biologie, Biochemie und Bioinformatik. Wir arbeiten in hochmodernen Laboren mit Zugang zu sämtlichen relevanten Technologien. Großen Wert legen wir auf eine strukturierte wissenschaftliche Betreuung und ein erfolgreiches Onboarding.
Unsere Forschung wird von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG), der Deutschen Krebshilfe (DKFZ), der Hector Stiftung, der Else Kröner-Fresenius-Stiftung (EKFS) sowie weiteren Förderern unterstützt. Das Projekt baut auf umfangreichen Vorarbeiten auf, in deren Rahmen wir eine neuartige Single-Cell-Sequenzierungstechnologie zur Analyse genomweiter Krebs-Screens entwickelt haben. Diese Technologie soll nun für umfassende funktionelle Screenings eingesetzt und durch mehrere hochmoderne Technologien sowie Validierungsplattformen ergänzt werden.
Die Stelle im Überblick

- Translationales PhD-Projekt mit bioinformatischem Schwerpunkt zur Identifikation von Biomarkern, die eine frühe Prävention und die Vorhersage der Progression von Myelom-Vorstufen zu einer aktiven Erkrankung ermöglichen
- Entwicklung und Evaluierung gezielter therapeutischer Strategien für Patientinnen und Patienten mit schwer behandelbarem Myelom
- Bioinformatische Analyse eines genomweiten Transposon-Mutagenese-Screens in CCND1- und MMSET-deregulierten Plasmazelltumoren in einem Mausmodell sowie in entsprechenden humanen Bioproben
- Analyse der resultierenden Tumoren mittels hochdimensionaler spektraler Durchflusszytometrie
- Bulk- und Single-Cell-Analysen der resultierenden Tumoren in enger Zusammenarbeit und mit Synergien zu einem parallelen Single-Cell-Projekt unserer Arbeitsgruppe am Max-Delbrück-Center (BIMSB)
- Klonalitätsanalyse gepaarter MGUS-/Myelom-Proben zur Identifikation von Risikogenen für die Transformation in ein multiples Myelom
- Ableitung nachfolgender mechanistischer Studien und Übertragung der Ergebnisse in den Kontext der humanen Erkrankung in enger Zusammenarbeit mit weiteren Forschenden
- Anwendung eines breiten Methodenspektrums: Single-Cell-Analysen, RNA-/DNA-Sequenzierung, Proteomik, spektrale Durchflusszytometrie und CRISPR-Screens

Danach suchen wir

- Masterabschluss (oder gleichwertiger Abschluss), vorzugsweise in Bioinformatik, Computational Biology oder einer verwandten naturwissenschaftlichen Disziplin mit starkem Schwerpunkt auf Bioinformatik und/oder Datenanalyse
- Hohe Motivation, Fähigkeit zu selbstständigem wissenschaftlichem Arbeiten, lösungsorientiertes Denken sowie ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeiten
- Grundkenntnisse in statistischer Testung sowie in Molekular- und Zellbiologie
- Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
- Wünschenswert: Praktische Erfahrung mit High-Performance-Computing-(HPC-)Umgebungen und dem Management großer Datenmengen

Das bringt die Charité mit

- Eine hoch professionelle Zusammenarbeit in einem motivierten und interdisziplinären Team
- Eine zukunftsorientierte, abwechslungsreiche und anspruchsvolle Tätigkeit mit hoher Eigenverantwortung und persönlichem Handlungsspielraum
- Umfangreiche kostenfreie Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
- Vergünstigungen bei vielen Angeboten für Beschäftigte für die Bereiche Shopping, Reisen, Sport
- Eine zusätzliche Absicherung im Alter durch unsere betriebliche Altersvorsorge
- Seit 2007 zertifiziert als familiengerechte Hochschule und familiengerechtes Unternehmen - Weitere Informationen finden Sie hier
- Der Mitarbeiterin oder dem Mitarbeiter (d/w/m) wird nach §110 BerlHG Zeit für die eigene wissenschaftliche Qualifikation zur Verfügung gestellt.