Das Leibniz-Institut für Analytische Wissenschaften - ISAS - e.V. entwickelt Analyseverfahren für die Gesundheitsforschung. Mit seinen Innovationen trägt es dazu bei, die Prävention, Frühdiagnose und Therapie von beispielsweise Herz-Kreislauf-Erkrankungen oder Krebs zu verbessern. Ziel des Instituts ist es, die personalisierte Therapie voranzutreiben. Dafür kombiniert das ISAS Wissen aus Biologie, Chemie, Informatik, Medizin, Pharmakologie und Physik. Das ISAS ist Mitglied der Leibniz-Gemeinschaft und wird durch die Bundesrepublik Deutschland und ihre Länder öffentlich gefördert.

An unserem Standort in Dortmund suchen wir für die Arbeitsgruppe Analysis of Microscopic BIOMedical Images (AMBIOM):

Doktorand:in (m/w/d)

Die Stelle ist Teil des DFG-geförderten Projekts: ComplexEye - ein Array-Mikroskop für die gleichzeitige Zeitraffer-Videomikroskopie in 96/384 Well-Platten, das Einzelzellanalysen mit hohem Durchsatz von schnell wandernden Zellen ermöglicht.

Die Vollzeitstelle ist ab sofort verfügbar und befristet auf 3 Jahre. Die Vergütung erfolgt in Anlehnung an den TV-L. Die Befristung des Vertrages richtet sich nach dem Wissenschaftszeitvertragsgesetz (WissZeitVG).

Frauen werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt berücksichtigt, sofern Frauen in der jeweiligen Organisationseinheit unterrepräsentiert sind und nicht in der Person eines Mitbewerbers liegende Gründe überwiegen. Bewerbungen von für die Position qualifizierten schwerbehinderten oder diesen gleichgestellten Personen werden ausdrücklich begrüßt.

Das ISAS erhebt und verarbeitet die persönlichen Daten seiner Bewerber:innen gemäß den europäischen und deutschen gesetzlichen Bestimmungen. Weitere Informationen zum Datenschutz und zur Verarbeitung personenbezogener Daten erhalten Sie unter https://www.isas.de/datenschutz-fuer-bewerber-innen.
Entwicklung neuer Machine-Learning-Algorithmen für die Analyse von Mikroskopiebilddaten (hauptsächlich 2D-Zeitrafferaufnahmen), basierend auf realen Anwendungen in der lebenswissenschaftlichen Forschung
Entwicklung von Lösungen zur Integration großer Foundation-Modelle in Workflows zur Mikroskopiebildanalyse und analytischen Datenanalyse gemeinsam mit anderen Teammitgliedern
Neue grundlegende Modelle für die Analyse von Mikroskopbildern entwickeln
Implementierung KI-basierter Software zur Mikroskopiebildanalyse in Python
Publikation von Ergebnissen und Methoden in Konferenzbeiträgen und Fachzeitschriften

Master-, Diplom- oder gleichwertiger Abschluss in Informatik/Computer Engineering/Statistik/angewandter Mathematik/Data Science/Biomedizintechnik oder in einem relevanten wissenschaftlichen Bereich
Fundierte Kenntnisse im Bereich maschinelles Lernen
Umfassende Erfahrung im Bereich Computer Vision oder Bildanalyse
Gute Kenntnisse in Deep-Learning-Paketen wie PyTorch
Erfahrung mit Foundation-Modellen (Large Vision Models oder multimodalen Large Language Models)
Gute Präsentations- und Schreibfähigkeiten
Proaktive, eigenständige und lösungsorientierte Arbeitsweise
Fließendes Englisch (in Wort und Schrift)
Veröffentlichungen bei hochrangigen Computer-Vision-Konferenzen oder in Fachzeitschriften sind von Vorteil
Erfahrung in der Entwicklung von Open-Source-Software ist von Vorteil

Ein klares Forschungsthema sowie eine vielseitige Ausbildung und Betreuung von Doktoranden am ISAS und im Rahmen der Leibniz-Gemeinschaft
Fortbildungs- und wissenschaftliche Entwicklungsmöglichkeiten in einem internationalen Umfeld und eine hervorragende Arbeitsatmosphäre in einem sehr dynamischen und professionellen Team
Umfangreiche Ausstattung und Infrastruktur auf dem neuesten Stand der Technik in verschiedenen analytischen Methoden
Die Möglichkeit, Ihre Daten auf internationalen Konferenzen zu präsentieren und an Workshops teilzunehmen
Flexible Arbeitszeiten, mobiles Arbeiten und attraktive Sozialleistungen;
Unterstützung bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie (u.a. Suche nach Kinderbetreuun...